Детско-юношеская спортивная школа №3 была открыта 20 сентября 1955.

Изначально, в школе культивировались такие виды спорта, как волейбол, баскетбол, легкая атлетика, гимнастика и плавание.

В 1956 году были открыты отделения пулевой стрельбы, водного поло, прыжков в воду, велоспорта, тенниса и футбола.

В 1957 году открыты отделения настольного тенниса и бокса.

В 1976 году, в связи с открытием детских спортивных школ в городе и области остается 2 отделения — теннис, настольный теннис;

Стариков Василий Ефимович – основатель настольного тенниса в г. Ростове-на-Дону.

1 сентября 2006 года в школе открыты отделения бильярдного и танцевального спорта, а 1 сентября 2007 года – отделение по бадминтону.

В 1999 году ДЮСШ-3 присвоен статус специализированной детско-юношеской школы олимпийского резерва.

В 2012 году школа переименована в муниципальное бюджетное образовательное учреждение дополнительного образования детей детско-юношеская спортивная школа № 3 города Ростова-на-Дону.

На основании Постановления Администрации города Ростова-на-Дону № 289 от 23.04.2015г школа переименована в муниципальное бюджетное учреждение дополнительного образования города Ростова-на-Дону «Детско-юношеская спортивная школа № 3».

На основании Распоряжения Управления образования города Ростова-на-Дону № УОР-5 от 16.02.2023г школа переименована в муниципальное бюджетное учреждение дополнительного образования города Ростова-на-Дону «Спортивная школа № 3».

В 2019 году благодаря администрации города Ростова-на-Дону, в лице губернатора Ростовской области МБУ ДО СШ №3 были выделены деньги на выборочный капитальный ремонт помещений и в 2020 году и, впервые за всю свою историю, в свое 65-летие, может осуществлять образовательный процесс по видам спорта настольный теннис и танцевальный спорт на собственной спортивной базе.

Представительств и филиалов МБУ ДО СШ №3 не имеет.

В 2024 году в МБУ ДО СШ №3 открыто отделение чир спорта.

Директора  школы за период ее существования:

▸ 1955 — 1966 Писарев Василий Афанасьевич;

▸ 1967 — 1969 Маслов Виталий Федорович;

▸ 1969 — 1988 Орлюк Леонид Николаевич;

▸1988 — 2004 Петрова Людмила Александровна «Отличник физической культуры и спорта;

▸ 2004 — 2025 Бугольцева Людмила Сергеевна Заслуженный работник физической культуры Российской Федерации, «Отличник физической культуры и спорта»

▸ 2026 — по настоящее время и. о. директора Васильев Максим Вадимович